Odkryte niedawno na terenie budowy muzeum średniowieczne groby mogą spowodować wstrzymanie robót budowlanych, a to na jak długo zależy od Wojewódzkiego Konserwatora Zabytków.
Wstrzymanie robót, a w konsekwencji przesunięcie planowanego terminu oddania budynku do użytku (zgodnie z planem sierpień 2007) może być przyczyną komplikacji natury finansowej. Pamiętać należy, że inwestycja finansowana jest z funduszy unijnych, które maja określony czas wydatkowania. Nie oddanie budynku MNZP na czas może spowodować cofnięcie dotacji.